Los sistemas de asistencia al conductor en un coche familiar para protegerlo ante situaciones peligrosas nunca son demasiados. Por ejemplo, el Octavia Combi puede hacer frente a las siguientes situaciones: supervisa el tráfico en sentido contrario cuando giras a la izquierda (con volante a la izquierda) y detiene el coche si hay peligro. Una vez aparcado el coche, vigila la zona de detrás y te avisa si hay riesgo de golpear a otro coche o a un ciclista al abrir la puerta.

En caso de accidente, los ocupantes están protegidos por un cuerpo robusto con amplias zonas de deformación y hasta 10 airbags, que interactúan de forma precisa con los cinturones de seguridad automáticos de tres puntos y los reposacabezas de seguridad. Otras funciones de seguridad incluyen modernos sistemas electrónicos diseñados para mitigar las consecuencias de un accidente, como el Frenado multicolisión o el sistema Crew Protect Assist delantero y trasero.

El Octavia Combi incorpora el sistema eCall, que comunica información como la ubicación del coche, el número de personas que viajan en él, la posición del vehículo antes y después del accidente y su estado en caso de accidente. También puede activarse manualmente en cualquier momento mediante unos botones situados en el módulo del techo.

Euro NCAP ha concedido al Škoda Octavia la máxima calificación posible de cinco estrellas, certificando así que el coche ofrece una protección óptima para todos los que van a bordo.

En la categoría Protección de Ocupantes Infantiles, el Octavia recibió una puntuación del 88 % de todos los puntos posibles. Esto sitúa al Octavia en el extremo superior de todos los coches probados. En la categoría Protección de Ocupantes Adultos, el Octavia obtuvo un 92 %.